ঢাকা বিশ্ববিদ্যালয়ের কার্জন হল প্রাঙ্গণে শহীদুল্লাহ হলের উত্তর-পশ্চিম কোণে আনুমানিক ১৬৭৯ সালে মুসা খাঁর মসজিদ নির্মিত হয়। মুসা খানের মসজিদ বা মুসা খাঁর মসজিদ(Musa Khan Masjid) নামেও মধ্যযুগীয় এ মসজিদটি পরিচিত। ধারণা করা হয়, এ মসজিদটি ঈসা খাঁর পুত্র মুসা খান নির্মাণ করেন এবং তার নামে নামকরন করেন।
মুসা খান মসজিদটি দেখতে অনেকটা খাজা শাহবাজের মসজিদের (তিন নেতার মাজারের পেছনে) মতো। ভূমি থেকে উঁচু মঞ্চের ওপর মসজিদটি নির্মিত। নিচে অর্থাৎ মঞ্চের মতো অংশে আছে ছোট ছোট প্রকোষ্ঠ। এগুলো এখন বন্ধ। দক্ষিণ পাশ দিয়ে ১২ ধাপ সিঁড়ি বেয়ে উঠতে হয় মসজিদের দরজায়। পূর্ব দিকে খোলা বারান্দা। চওড়া দেয়াল।
পূর্ব-পশ্চিমের দেয়াল ১ দশমিক ৮১ মিটার ও উত্তর-দক্ষিণের দেয়াল ১ দশমিক ২ মিটার চওড়া। পূর্বের দেয়ালে তিনটি ও উত্তর-দক্ষিণে দুটি খিলান দরজা। ভেতরে পশ্চিম দেয়ালের মধ্যে একটি প্রধান ও পাশে দুটি ছোট মেহরাব। চারপাশের দেয়ালে মোগলরীতির নকশা। বাইরের দেয়ালের চার কোণে চারটি মিনারখচিত আট কোণ বুরুজ। তার পাশে ছোট ছোট মিনার। বুরুজ ও ছোট মিনার ১৬টি। ছাদে তিনটি গম্বুজ। মাঝেরটি বড়। ওপরের কার্নিশ নকশাখচিত।
কিভাবে যাবেন –
ঢাকার পুরোনো দিনের গৌরবের স্মৃতিবহন করা এ মসজিদে যেতে হলে প্রথমে আপনাকে আসাতে হবে শাহবাগ অথবা গুলিস্থান । তারপর সেখান থেকে রিক্সা কিংবা সিএনজি।